L'IFRH a défini pour ce quinquennat quatre programmes transversaux :

• Handicap de l'enfant
• Systèmes interactifs pour la Participation et l'Autonomie (SIPA)
• Handicap et Mobilité
• Trajectoires et accompagnement

Son activité de recherche est aussi organisée autour de projets de recherche collaboratifs au sein de ses trois axes de travail :

• Recherches en Santé Publique et Sciences Humaines et Sociales
  
• Recherche clinique et Sciences de la Réadaptation
• Technologies Appliquées aux Grandes Déficiences et au Handicap
  

ou en collaborations entre ces axes disciplinaires.

L'IFRH a été amené à mettre en place des plateformes intégrées.